Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Higd1cQ76I25 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms