Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms