Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms