Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms