Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX46

ALKAL2, ALK and LTK ligand 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2Q6UX46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALKAL2Q6UX46 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKAL2Q6UX46 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms