Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms