Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms