Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms