Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms