Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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