Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Swap70Q6A028 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms