Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms