Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms