Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga6Q61739 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms