Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde3bQ61409 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms