Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PcolceQ61398 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcolceQ61398 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms