Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JrkQ60976 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrkQ60976 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JrkQ60976 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrkQ60976 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms