Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DbpQ60925 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms