Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgaeQ60677 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgaeQ60677 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms