Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtprnQ60673 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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