Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav6-2Q5R1I4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav6-2Q5R1I4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms