Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsrp1Q5NCR9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsrp1Q5NCR9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nsrp1Q5NCR9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsrp1Q5NCR9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms