Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Trim41Q5NCC3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim41Q5NCC3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms