Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DroshaQ5HZJ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DroshaQ5HZJ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DroshaQ5HZJ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms