Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnni3kQ5GIG6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms