Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmtc2Q56A06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmtc2Q56A06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms