Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ57

Axdnd1, Axonemal dynein light chain domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Axdnd1Q3UZ57 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Axdnd1Q3UZ57 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Axdnd1Q3UZ57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms