Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms