Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cobll1Q3UMF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms