Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Babam1Q3UI43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Babam1Q3UI43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Babam1Q3UI43 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms