Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms