Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf149Q3U2C5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf149Q3U2C5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf149Q3U2C5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf149Q3U2C5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf149Q3U2C5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf149Q3U2C5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf149Q3U2C5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf149Q3U2C5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf149Q3U2C5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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