Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U1D9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms