Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms