Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pde12Q3TIU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pde12Q3TIU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde12Q3TIU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde12Q3TIU4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms