Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms