Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox4cQ2MDG1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms