Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap9Q1HDU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap9Q1HDU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap9Q1HDU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arhgap9Q1HDU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms