Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap25Q1EHW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap25Q1EHW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap25Q1EHW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sap25Q1EHW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sap25Q1EHW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms