Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SGCAQ16586 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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SGCAQ16586 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SGCAQ16586 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCAQ16586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SGCAQ16586 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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