Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RAB35Q15286 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RAB35Q15286 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RAB35Q15286 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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