Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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ptchd1Q14B62 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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ptchd1Q14B62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms