Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ECH1Q13011 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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