Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 NEM1YHR004C 1341 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RPS14AYCR031C 414 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 TSC13YDL015C 933 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 APA2YDR530C 978 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YEL010WYEL010W 351 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 COG7YGL005C 840 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RSM27YGR215W 333 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SPO11YHL022C 1197 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 EST3YIL009C-A 546 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 POG1YIL122W 1056 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YLR297WYLR297W 390 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SSO2YMR183C 888 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 CAF20YOR276W 486 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 NTO1YPR031W 2247 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 UTP25YIL091C 2166 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SST2YLR452C 2097 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 DSL1YNL258C 2265 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 EPO1YMR124W 2832 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YPL216WYPL216W 3309 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 ATP16YDL004W 483 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 GRX3YDR098C 858 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 COX6YHR051W 447 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YVH1YIR026C 1095 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RCE1YMR274C 948 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RPA43YOR340C 981 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 DSS1YMR287C 2910 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 PGS1YCL004W 1566 nt3.55□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YGL138CYGL138C 1038 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 TDA10YGR205W 873 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 UNG1YML021C 1080 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 URA5YML106W 681 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SAS5YOR213C 747 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SUR1YPL057C 1149 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 PRM4YPL156C 855 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 PIN3YPR154W 648 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 TPD3YAL016W 1908 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 MAK21YDR060W 3078 nt3.54□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YGR117CYGR117C 1431 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RUB1YDR139C 234 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RPS25AYGR027C 327 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 BTN2YGR142W 1233 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YKE4YIL023C 1041 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SIL1YOL031C 1266 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SRL4YPL033C 846 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YPL107WYPL107W 747 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 ATP20YPR020W 348 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 CBP6YBR120C 489 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 GIS4YML006C 2325 nt3.53□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 TFC4YGR047C 3078 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SEC6YIL068C 2418 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YOR365CYOR365C 2112 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 BI3Q0115 1554 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SDS23YGL056C 1584 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 GPM2YDL021W 936 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 UBC9YDL064W 474 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YDR355CYDR355C 303 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 OST5YGL226C-A 261 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YKL091CYKL091C 933 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 TEM1YML064C 738 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 snR11snR11 258 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 DDP1YOR163W 567 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 ENA5YDR038C 3276 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RRM3YHR031C 2172 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RAD5YLR032W 3510 nt3.52□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 KIN3YAR018C 1308 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SAG1YJR004C 1953 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SMI1YGR229C 1518 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YCR085WYCR085W 354 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 OPI6YDL096C 327 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YDL242WYDL242W 354 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 QCR10YHR001W-A 234 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 PET130YJL023C 1044 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YLL037WYLL037W 381 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 ERG29YMR134W 714 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YBR242WYBR242W 717 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 ERG11YHR007C 1593 nt3.51□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 MON1YGL124C 1935 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 STE23YLR389C 3084 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 AEP3YPL005W 1821 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YJL032WYJL032W 315 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 OST6YML019W 999 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RPS10AYOR293W 318 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 HEH2YDR458C 1992 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 ARP9YMR033W 1404 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 CAF120YNL278W 3183 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SEC59YMR013C 1560 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 GYP6YJL044C 1377 nt3.5□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 ESL2YKR096W 3588 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 UTP5YDR398W 1932 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 BSC1YDL037C 987 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 UBC5YDR059C 447 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 HTB1YDR224C 396 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 PXR1YGR280C 816 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YHL005CYHL005C 393 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 SVP26YHR181W 687 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 AGE2YIL044C 897 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YKL131WYKL131W 522 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 GLO1YML004C 981 nt3.49□□□□□ -1.85
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