Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r2Q0VGB7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r2Q0VGB7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp4r2Q0VGB7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms