Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms