Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emx1Q04742 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx1Q04742 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms