Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms