Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Runx1Q03347 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Runx1Q03347 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms