Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms